Soutenance de thèse de Maud Jusot

Maud Jusot, doctorante dans l'équipe BIBIP, soutient sa thèse le mercredi 3 octobre 2018 à 14 h.
IMPMC - Sorbonne Université - 4 place Jussieu, 75005 Paris, tour 23, 4e étage, couloir 22-23, salle 401
Description de l'espace conformationnel de peptides cycliques de la famille RGD par une approche inspirée de la robotique et par des simulations de dynamique moléculaire
Résumé
Les petits peptides cycliques représentent une classe émergente et prometteuse de molécules thérapeutiques. Cependant, le manque de connaissance de leur espace conformationnel rend difficile leur conception et la prédiction de leur structure. Afin de pouvoir améliorer les connaissances sur ces molécules aux propriétés uniques, nous avons voulu développer une approche alternative à celles existantes permettant la caractérisation la plus précise possible de leur espace conformationnel. Pour cela, nous avons développé une méthode EGSCyP, s'appuyant sur une représentation multi-niveaux du peptide : une représentation mécanique et l'utilisation d'algorithme issus du domaine de la robotique permettant une approche globale puis une amélioration de la précision en modèle tout atome. EGSCyP a été développé pour gérer les résidus modifiés tels que les résidus de forme D et N-méthylés. Cette méthode a été comparée à des simulations de dynamique moléculaire par échange de répliques et des données expérimentales pour la valider. Elle a été appliquée à un ensemble de pentapeptides cycliques RGD dérivés de la Cilengitide, un anticancéreux. Notre approche a montré de bonnes performances notamment en ce qui concerne la complétude de l'espace conformationnel de ces peptides et a permis d'évaluer l'impact des modifications chimiques telles que les résidus en forme D ou N-méthylés sur ce paysage conformationnel.
Mots clés : peptides cycliques, robotique, dynamique moléculaire, RGD, Cilengitide.
Jury
Chantal Prévost, CR (LBT - IBPC) - Rapporteur
Pierre Tufféry, DR (MTI, Université Paris 7) - Rapporteur
Alessandra Carbone, Professeure (LCQB, Sorbonne Université) - Examinatrice
Claire Minoletti-Hochepied, IR (Sanofi-aventis) - Examinatrice
Jacques Chomilier, DR (IMPMC, Sorbonne Université) - Directeur de thèse
Juan Cortés, DR (LAAS-CNRS, Toulouse) - Co-directeur de thèse
Dirk Stratmann, MC (IMPMC, Sorbonne Université) - Co-encadrant
Egalement dans la rubrique
- Soutenance de thèse de Maxime Ficheux
- Soutenance de thèse de Fei He
- Soutenance de thèse de Pauline Glatz
- Soutenance de thèse de Natan Capobianco
- Soutenance de thèse d'Eric Edmund
- Soutenance de thèse de Lucie Stetten
- Soutenance de thèse de Maxilmilien Mathian
- Soutenance de thèse d'Ornella Vaccarelli
- Soutenance de thèse d'Edoardo Sterpetti
- Soutenance de thèse de Nadir Bizi
- Soutenance de thèse de Félix Mouhat
- Soutenance de thèse de Julie Aufort
- Soutenance de thèse de Blair Lebert
Zoom Science - Une nouvelle bactérie championne de la biominéralisation - Janvier 2021

Certaines bactéries sont capables de former des phases minérales. Ceci a de nombreuses implications aussi bien pour les processus chimiques se déroulant à la surface de la Terre, la recherche de traces de vie passée, la synthèse de nouveaux matériaux ou bien le développement de procédés de dépollution...
Contact
Guillaume Fiquet
Directeur de l'institut
guillaume.fiquet(at)upmc.fr
Bruno Moal
Administrateur
33 +1 44 27 52 17
bruno.moal(at)upmc.fr
Jérôme Normand
Gestion du personnel
Réservation des salles
jerome.normand(at)upmc.fr
Antonella Intili
Accueil et logistique
Réservation des salles
antonella.intili(at)upmc.fr
Danielle Raddas
Responsable financière
danielle.raddas(at)upmc.fr
Cécile Duflot
Communication
cecile.duflot(at)upmc.fr
33 +1 44 27 46 86
Contact unique pour l'expertise de météorites
Contact unique pour l'expertise de matériaux et minéraux
Stages d'observation pour élèves de 3e et de Seconde
feriel.skouri-panet(at)upmc.fr
Adresse postale
Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie - UMR 7590
Sorbonne Université - 4, place Jussieu - BC 115 - 75252 Paris Cedex 5
Adresse physique
Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie - UMR 7590 - Sorbonne Université - 4, place Jussieu - Tour 23 - Barre 22-23, 4e étage - 75252 Paris Cedex 5
Adresse de livraison
Accès : 7 quai Saint Bernard - 75005 Paris, Tour 22.
Contact : Antonella Intili : Barre 22-23, 4e étage, pièce 420, 33 +1 44 27 25 61
Fax : 33 +1 44 27 51 52
L'IMPMC en chiffres
L'IMPMC compte environ 195 personnes dont :
- 40 chercheurs CNRS
- 46 enseignants-chercheurs
- 19 ITA CNRS
- 15 ITA non CNRS
- 50 doctorants
- 13 post-doctorants
- 12 bénévoles
Chiffres : janvier 2016