Séminaire du lundi 11 février 2013 10h30
IMPMC - Université Pierre et Marie Curie - 4, place Jussieu - 75005 Paris
Salle de conférence, 4e étage, Tour 22-23
BIOINFORMATICS TOOLS FOR TRANSCRIPTOME ANALYSES IN YEASTS
Gaëlle Lelandais, Institut Jacques Monod, Université Paris Diderot - Paris 7
Abstract :
The characterization of gene regulatory networks (GRN) raises challenging questions regarding both the choice of the experimental datasets and the bioinformatics methodologies to examine these data.
In this context, transcriptome analyses give valuable information. Strategies to optimize simultaneously (i) the discovery and (ii) the cross species comparisons of GRNs will be presented and illustrated with the analysis of the transcriptional programs that drive the chemical stress response in three yeast species: the model yeast Saccharomyces cerevisiae and two pathogenic species Candida glabrata and Candida albicans.
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