Séminaire du lundi 15 avril 2013 à 10h30

IMPMC, Université P. et M. Curie, 4, Place Jussieu, 75005 Paris

Salle de Conférence, 4^e étage, Tour 22-23, Salle 1

LA BIOINFORMATIQUE APPLIQUéE AUX PROTéINES : RELATIONS SéQUENCE-STRUCTURE-FONCTION

Elodie Duprat, IMPMC,UPMC

 

La bioinformatique est un champ de recherche pluridisciplinaire visant à l'interprétation de l'information biologique (génétique, structurale, ...) et à la modélisation des processus en biologie. Les protéines sont des acteurs essentiels du vivant, en raison de l’importance et de la diversité des fonctions qu’elles assurent et des interactions qu’elles établissent. Un enjeu majeur de leur étude par des approches de bioinformatique couplées à une démarche expérimentale est la compréhension des relations existant entre leur séquence (succession d’acides aminés liés par des liaisons covalentes), leur structure tridimensionnelle (ou repliement selon une conformation énergétiquement stable dans des conditions physico-chimiques données) et leurs fonctions biologiques. 
Je présenterai ici l'étude des relations séquence-structure-fonction de trois superfamilles de protéines représentées dans tous les organismes, des bactéries à l'Homme : les beta/gamma-cristallines, les petites protéines de choc thermique, les phosphatases alcalines.